この記事の書き方ではまったくもって同感ですが別の視点から言えば
「遅起きを許す家庭の子供は学校が嫌いになりやすい」とは言えるのではないでしょうか。
親がだらけていれば子供もだらける。
ちょっとした事で学校を休んだり、休ませたり。
生活リズムが乱れていれば体調も崩しやすいでしょうし
授業に（小学生程度の）集中もできなかったり
友達と一緒に遊ばなかったりして学校が好きになりにくい、とは言えるのでは？

教育がうまくいけば国が栄えるというのは、ま、常識だし、官民あげてその方向に努力するのが望ましいと思う。そこで「学校が好きで楽しい子供は早起きだ」という有意の統計結果が出た。これは見るところ不可逆的な関係ではないから、これを見て前向きの親は多分早起きを奨励するだろう。その結果学校嫌いの子供が学校を好きになる確率は統計学的に有意でいい結果が出るはずだ。たとえ有意な結果が出なくても、少なくも悪い方向へはいかないだろう。

嘘、真っ赤な嘘、統計。
嘘を大まかに類別するとこの三つに集約されるそうです。